More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0755 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0755  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
479 aa  942    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.610335 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0209  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.15 
 
 
473 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.452088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1935  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.22 
 
 
472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.758736  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1605  NADH dehydrogenase (quinone)  46.08 
 
 
475 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  33.19 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  31.85 
 
 
478 aa  229  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.13 
 
 
482 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  32.54 
 
 
482 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1267  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.07 
 
 
516 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  34.81 
 
 
476 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.94 
 
 
516 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.02 
 
 
492 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.62 
 
 
488 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  34.73 
 
 
478 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2581  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.74 
 
 
516 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0861426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  33.64 
 
 
481 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.91 
 
 
484 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.5 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.69 
 
 
484 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.05 
 
 
477 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.11 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.56 
 
 
502 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.95 
 
 
491 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  33.41 
 
 
490 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.6 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  33.73 
 
 
488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  32.34 
 
 
490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  33.65 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  33.49 
 
 
488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.83 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.47 
 
 
518 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  32.7 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.43 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  33.66 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13179  NADH dehydrogenase subunit N  33.33 
 
 
531 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000788035  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  32.29 
 
 
485 aa  213  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  34.17 
 
 
478 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  31.88 
 
 
480 aa  213  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  33.66 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  33.66 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.5 
 
 
511 aa  212  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.58 
 
 
483 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  33.66 
 
 
489 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.07 
 
 
483 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.89 
 
 
513 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.58 
 
 
484 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  34.33 
 
 
478 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  35 
 
 
475 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  30.44 
 
 
484 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  33.4 
 
 
478 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1287  F420H2 dehydrogenase subunit N  32.03 
 
 
480 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000180971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  33.4 
 
 
478 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.03 
 
 
482 aa  210  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.11 
 
 
487 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  34.11 
 
 
499 aa  209  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.34 
 
 
511 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3813  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.02 
 
 
479 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1287  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain N  36.67 
 
 
524 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  32.2 
 
 
478 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4494  NADH dehydrogenase subunit N  35.04 
 
 
527 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.78 
 
 
477 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.66 
 
 
505 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  33.56 
 
 
491 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  30.32 
 
 
476 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.11 
 
 
498 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.41 
 
 
511 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
492 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3291  NADH dehydrogenase subunit N  30.11 
 
 
492 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  32.15 
 
 
511 aa  206  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.46 
 
 
476 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  32.19 
 
 
494 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6669  NADH dehydrogenase subunit N  34.68 
 
 
527 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  33.26 
 
 
521 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  31.69 
 
 
478 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  31.69 
 
 
478 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  33.07 
 
 
479 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  32.85 
 
 
494 aa  204  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  34.53 
 
 
489 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0987  NADH dehydrogenase subunit N  33.7 
 
 
566 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  32.29 
 
 
480 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  32.81 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  33.26 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  31.77 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  32.94 
 
 
485 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1564  NADH dehydrogenase subunit N  35.77 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  32.6 
 
 
479 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4405  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  33.42 
 
 
521 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1588  NADH dehydrogenase subunit N  35.77 
 
 
524 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  31.61 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  34.15 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  32.01 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.12 
 
 
506 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  33.1 
 
 
481 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>