83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0113 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  100 
 
 		 87 aa  185  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  40.85 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  40.3 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  35.29 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32.26 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  39.34 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  39.34 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.43 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  42.55 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  32.79 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  35.82 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  32.79 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  30.65 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  30.3 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  47.5 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  29.17 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  32.39 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  37.1 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  31.43 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  33.33 
 
 		 391 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  28.95 
 
 		 249 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.71 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  35.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  30.67 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  35.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.26 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  36.54 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  33.33 
 
 		 383 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  39.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2369  glutaredoxin  32.39 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0319726  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  32.86 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  32.86 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  38.46 
 
 		 395 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  27.27 
 
 		 78 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  31.94 
 
 		 84 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  28.75 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40 
 
 		 459 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  26.58 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  27.14 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  34.29 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  27.78 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  32.69 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  32.69 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2348  glutaredoxin  37.25 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0181488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  33.93 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  22.03 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.09 
 
 		 398 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  31.94 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  29.49 
 
 		 88 aa  40  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3239  glutaredoxin  30.51 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0851867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  30.56 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  30 
 
 		 243 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  26.39 
 
 		 105 aa  40  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  30 
 
 		 243 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  30 
 
 		 243 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>