More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0434 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0387  Superoxide dismutase  78.71 
 
 
202 aa  324  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333361  normal  0.539413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  74.5 
 
 
201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  56.41 
 
 
199 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  56.72 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  55.22 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  54.73 
 
 
199 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  56.5 
 
 
199 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  56.41 
 
 
199 aa  217  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  56.8 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  57.77 
 
 
199 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  55.5 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  56.06 
 
 
201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  55.38 
 
 
199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  57.77 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  55.39 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  55.12 
 
 
199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  54.68 
 
 
199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  56.37 
 
 
199 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  54.36 
 
 
199 aa  211  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  54.68 
 
 
200 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  54.68 
 
 
227 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  54.46 
 
 
199 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  54.37 
 
 
199 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  56.5 
 
 
198 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  55.39 
 
 
199 aa  207  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  54.19 
 
 
201 aa  206  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  54.37 
 
 
198 aa  205  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  54.82 
 
 
199 aa  201  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  54.31 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  54.31 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  54.55 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  50 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  52.94 
 
 
200 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.14 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.14 
 
 
199 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  50.75 
 
 
229 aa  192  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  50 
 
 
198 aa  191  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  50.75 
 
 
209 aa  191  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2933  superoxide dismutase  49.75 
 
 
210 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  50 
 
 
209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  47.29 
 
 
200 aa  188  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  53.33 
 
 
205 aa  187  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  48.28 
 
 
201 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1015  superoxide dismutase, Fe  49.5 
 
 
194 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.011206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  50 
 
 
200 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  50 
 
 
200 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  46.5 
 
 
198 aa  185  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  49.51 
 
 
201 aa  184  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  48.77 
 
 
200 aa  185  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  49.02 
 
 
200 aa  184  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  53.06 
 
 
192 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  50.51 
 
 
193 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  49.25 
 
 
209 aa  184  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  53.06 
 
 
192 aa  184  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  50 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  51.02 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  51.78 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  51.02 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  51.02 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  51.02 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  49.5 
 
 
193 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  50.26 
 
 
210 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  46.57 
 
 
241 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  50 
 
 
221 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1558  Superoxide dismutase  49 
 
 
193 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  48.51 
 
 
194 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  46.83 
 
 
206 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2301  superoxide dismutase  49 
 
 
193 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0685377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  52.11 
 
 
209 aa  180  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  49.49 
 
 
221 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  49.49 
 
 
221 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2180  superoxide dismutase  48.02 
 
 
194 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.678123  normal  0.116868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  47.78 
 
 
199 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  48.51 
 
 
193 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  50.51 
 
 
194 aa  178  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  49.49 
 
 
192 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  49.49 
 
 
192 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  49.49 
 
 
192 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  49.49 
 
 
192 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  49.49 
 
 
192 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  48.51 
 
 
193 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  49.75 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  48.51 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  48.51 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  46.23 
 
 
204 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  47.29 
 
 
200 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  49.25 
 
 
200 aa  178  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  49 
 
 
192 aa  178  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0923  superoxide dismutase  49.46 
 
 
246 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.790701  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1046  superoxide dismutase  49.46 
 
 
246 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  48.02 
 
 
193 aa  177  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3574  superoxide dismutase  49.24 
 
 
193 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0150898  hitchhiker  0.00946106 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  48.02 
 
 
193 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  47.26 
 
 
192 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>