More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4497 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  100 
 
 
199 aa  413  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  92.39 
 
 
199 aa  380  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  92.39 
 
 
199 aa  380  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  91.88 
 
 
199 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  90.4 
 
 
199 aa  377  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  90.4 
 
 
199 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  78.39 
 
 
199 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  77.27 
 
 
198 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  75.76 
 
 
198 aa  333  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  77.78 
 
 
198 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  76.88 
 
 
199 aa  330  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  73.87 
 
 
199 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  72.73 
 
 
199 aa  317  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  72.73 
 
 
199 aa  314  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  73.74 
 
 
198 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  72.86 
 
 
199 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  72.86 
 
 
199 aa  310  7.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  70.2 
 
 
199 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  69.5 
 
 
200 aa  299  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  69 
 
 
200 aa  299  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  67.66 
 
 
201 aa  298  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  68 
 
 
200 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  68 
 
 
200 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  72.22 
 
 
200 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  62.63 
 
 
198 aa  268  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  59.69 
 
 
199 aa  235  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  60.2 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  59.18 
 
 
199 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  59.18 
 
 
199 aa  232  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  53.27 
 
 
199 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  54.17 
 
 
197 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  51.76 
 
 
200 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  51.76 
 
 
200 aa  225  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  53.5 
 
 
201 aa  224  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  53.68 
 
 
229 aa  223  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  56.12 
 
 
199 aa  222  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  57.14 
 
 
199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  54.31 
 
 
209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  55.78 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  54.08 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  53.73 
 
 
201 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  51.76 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  52.36 
 
 
199 aa  212  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  51 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  56.37 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  53.06 
 
 
192 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  51.24 
 
 
203 aa  211  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  49.51 
 
 
206 aa  210  1e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  51.78 
 
 
209 aa  210  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  52.28 
 
 
209 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  51.49 
 
 
203 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0387  Superoxide dismutase  53.2 
 
 
202 aa  209  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333361  normal  0.539413 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  50.51 
 
 
199 aa  208  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  50.51 
 
 
199 aa  208  5e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  52.04 
 
 
193 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  52.82 
 
 
198 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  52.82 
 
 
198 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  52.55 
 
 
193 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  52.82 
 
 
198 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  50 
 
 
199 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  53.06 
 
 
193 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  52.82 
 
 
198 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  53.06 
 
 
193 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  49.5 
 
 
204 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  52.55 
 
 
233 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  52.53 
 
 
198 aa  206  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3260  superoxide dismutase  49.75 
 
 
203 aa  205  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  52.55 
 
 
233 aa  205  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  52.82 
 
 
198 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  51.44 
 
 
212 aa  205  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  51.27 
 
 
193 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  45.73 
 
 
201 aa  203  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  50.51 
 
 
199 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  52.55 
 
 
193 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  52.55 
 
 
193 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  52.55 
 
 
193 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  50 
 
 
204 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  52.04 
 
 
193 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  50.51 
 
 
193 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  52.04 
 
 
193 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  51.78 
 
 
201 aa  201  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2669  Superoxide dismutase  49.5 
 
 
203 aa  201  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.804084  normal  0.155291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  52.04 
 
 
193 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  50.51 
 
 
204 aa  201  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  46.97 
 
 
198 aa  201  9e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  49.5 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  50.51 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  47.74 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03175  superoxide dismutase  48.26 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  50.51 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  49.48 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  49.25 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  51.53 
 
 
193 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  51.32 
 
 
192 aa  198  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  50 
 
 
193 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  50 
 
 
193 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  49.49 
 
 
203 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  51.32 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  46.23 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  50 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>