More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0387 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0387  Superoxide dismutase  100 
 
 		 202 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333361  normal  0.539413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  78.71 
 
 		 216 aa  324  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  74.49 
 
 		 201 aa  295  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  58.97 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  55.67 
 
 		 201 aa  221  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  56.92 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  56.41 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  54.19 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  55.38 
 
 		 199 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  55.17 
 
 		 227 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  55.38 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  54.87 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  55.78 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  54.36 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  53.43 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  56.12 
 
 		 199 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  54.68 
 
 		 200 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  52.24 
 
 		 199 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  53.2 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  55.9 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  53.2 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  51.74 
 
 		 201 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  49.75 
 
 		 201 aa  204  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  52.22 
 
 		 198 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  52.24 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  52.45 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  53.17 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  51.23 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  51.23 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  51.71 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  51 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  51.96 
 
 		 198 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  50.74 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  49.26 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  50.74 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  49.26 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  48.77 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 199 aa  194  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  51.26 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  49.75 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  52.22 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  48.51 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  48.51 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  50.49 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  50.74 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2180  superoxide dismutase  49.5 
 
 		 194 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.678123  normal  0.116868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  50 
 
 		 200 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  49.51 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  48.28 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  48.51 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  49.51 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  50.51 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  49.75 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  49.03 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  52.58 
 
 		 205 aa  184  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  47.26 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1015  superoxide dismutase, Fe  46 
 
 		 194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  45 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  46.5 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  47.5 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  47 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  47.5 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  47.55 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  50 
 
 		 193 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  48 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  46.77 
 
 		 192 aa  181  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  46.77 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  45.05 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  49 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  48.02 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  45.5 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  46.12 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  48.5 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  49.21 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  46.5 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4203  Superoxide dismutase  48.06 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  48.5 
 
 		 192 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  45.5 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  45.5 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  45.5 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  45.1 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  45.5 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  45 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  45 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  49.5 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  47.03 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  47.03 
 
 		 193 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  45 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  47.03 
 
 		 193 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  47.45 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  45 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  45.81 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  46.53 
 
 		 193 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  50 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  44.39 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  44.06 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  46.43 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  46.53 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  45.5 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>