More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3498 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  98.49 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  97.99 
 
 		 199 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  92.39 
 
 		 199 aa  380  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  86.93 
 
 		 199 aa  363  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  86.43 
 
 		 199 aa  359  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  77.66 
 
 		 198 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  78.28 
 
 		 199 aa  328  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  77.27 
 
 		 198 aa  327  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  78.28 
 
 		 198 aa  327  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  78.28 
 
 		 199 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  74.24 
 
 		 199 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  73.37 
 
 		 199 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  73.87 
 
 		 199 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  74.24 
 
 		 198 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  73.74 
 
 		 199 aa  311  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  72.59 
 
 		 199 aa  309  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  70.71 
 
 		 199 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  70 
 
 		 201 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  71.21 
 
 		 200 aa  299  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  71.21 
 
 		 200 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  68.69 
 
 		 200 aa  287  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  68.69 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  71.86 
 
 		 200 aa  278  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  64.62 
 
 		 198 aa  270  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  53.27 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  59.69 
 
 		 199 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  59.18 
 
 		 199 aa  231  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  55.33 
 
 		 209 aa  231  6e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  52.79 
 
 		 197 aa  228  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  59.18 
 
 		 199 aa  227  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  50.75 
 
 		 200 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  50.75 
 
 		 200 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  54.4 
 
 		 199 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  52.88 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  52.24 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  58.67 
 
 		 199 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  57.65 
 
 		 199 aa  221  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  51.5 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  56.12 
 
 		 199 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  53.47 
 
 		 201 aa  218  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  53.12 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  52.38 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  53.57 
 
 		 192 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  53.85 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  52.31 
 
 		 199 aa  214  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  53.85 
 
 		 198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  51.5 
 
 		 203 aa  214  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  53.85 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  53.85 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  51.96 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  53.06 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  50.49 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  53 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  53.85 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  46.77 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  54.4 
 
 		 193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  52.76 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  53.89 
 
 		 193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  53.89 
 
 		 193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  54.4 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  52.55 
 
 		 193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  48 
 
 		 200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  53.89 
 
 		 193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  54.23 
 
 		 201 aa  211  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  53.37 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  50.25 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  50.98 
 
 		 204 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  53.68 
 
 		 204 aa  210  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  53.37 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  48 
 
 		 200 aa  209  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  52.58 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  50.5 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  52 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  53.37 
 
 		 233 aa  208  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  48.5 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  52.74 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  53.37 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  50.5 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  47.47 
 
 		 198 aa  207  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  50.5 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  52.55 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  52.33 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  52.58 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  52.58 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  51.81 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  51.81 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  51.81 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>