More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1890 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  94.44 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  93.43 
 
 		 198 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  89.95 
 
 		 199 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  87.88 
 
 		 199 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  82.32 
 
 		 198 aa  345  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  79 
 
 		 201 aa  341  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  78.79 
 
 		 199 aa  340  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  77.27 
 
 		 199 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  77.78 
 
 		 199 aa  334  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  78.79 
 
 		 199 aa  334  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  77.27 
 
 		 199 aa  333  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  78.28 
 
 		 199 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  79.29 
 
 		 198 aa  331  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  77.27 
 
 		 199 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  76.77 
 
 		 199 aa  328  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  77.27 
 
 		 199 aa  327  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  77.78 
 
 		 199 aa  325  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  77.27 
 
 		 200 aa  325  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  75.25 
 
 		 199 aa  320  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  74.24 
 
 		 200 aa  314  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  75.76 
 
 		 200 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  75.76 
 
 		 200 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  67.17 
 
 		 198 aa  285  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  70.2 
 
 		 200 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  60.41 
 
 		 199 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  59.9 
 
 		 199 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  56 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  56 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  59.39 
 
 		 199 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  54.73 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  59.39 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  58.08 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  59.39 
 
 		 199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  59.09 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  57.22 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  55.44 
 
 		 229 aa  226  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 201 aa  224  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 198 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  55.61 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  55.1 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  54.95 
 
 		 201 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  55.5 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  52.74 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  54.31 
 
 		 192 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  55.39 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  54.59 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  53.69 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  54.08 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  49.75 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  53.61 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  53.81 
 
 		 193 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1611  superoxide dismutase  51.5 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.308425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1645  superoxide dismutase  51.5 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.159138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  50 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 193 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 193 aa  210  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  51 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  52.5 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  48.5 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  55.15 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  55.15 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  55.73 
 
 		 193 aa  208  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  53.81 
 
 		 233 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  49 
 
 		 200 aa  207  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  53.81 
 
 		 233 aa  207  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  55.15 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  52.53 
 
 		 193 aa  207  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  52.26 
 
 		 198 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  46.77 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  53.65 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  53.65 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  53.81 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  48 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  54.64 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  54.27 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  53.81 
 
 		 192 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  53.69 
 
 		 201 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  54.87 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  48.24 
 
 		 198 aa  204  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  50.78 
 
 		 198 aa  203  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  51.78 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0387  Superoxide dismutase  51.71 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333361  normal  0.539413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  49.26 
 
 		 204 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>