More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1181 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0434  superoxide dismutase  74.5 
 
 		 216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0387  Superoxide dismutase  74.49 
 
 		 202 aa  295  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333361  normal  0.539413 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  56.22 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  55.28 
 
 		 199 aa  221  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  55.94 
 
 		 199 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  55.78 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  55.45 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  57 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  56.44 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  54.27 
 
 		 199 aa  217  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  55.28 
 
 		 198 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  54.95 
 
 		 199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  55.5 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  56 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  53.5 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.47 
 
 		 199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  54.23 
 
 		 199 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  56.5 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  52.97 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  54.5 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  52.97 
 
 		 199 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  55 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  53.73 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  53.73 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  55.5 
 
 		 198 aa  207  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  54.5 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  55.72 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  52.26 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  52.26 
 
 		 199 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  51.81 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  51.78 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.5 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  50.76 
 
 		 199 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.5 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  53 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0704  superoxide dismutase  53.12 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  49.48 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  48.22 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  49.74 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  50 
 
 		 209 aa  191  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  47.47 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  50.54 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  50.54 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  50.54 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  50 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  47.72 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  52.58 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  50 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  51.27 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  47.47 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  52.66 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  49.73 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  48.54 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  46.7 
 
 		 200 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  48.45 
 
 		 209 aa  184  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  46.7 
 
 		 200 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  46.43 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  48.65 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  48.65 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  46.99 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  48.65 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  47.55 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4221  Superoxide dismutase  51.87 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  46.94 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  50.26 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  49.73 
 
 		 193 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  49.73 
 
 		 193 aa  181  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  47.03 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  51.5 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  48.28 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  47.83 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1897  Superoxide dismutase  48.69 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  46.45 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  48.69 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  46.45 
 
 		 194 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  46.45 
 
 		 194 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  46.45 
 
 		 194 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  46.08 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5395  Superoxide dismutase  46.73 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  47.67 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  45.9 
 
 		 194 aa  177  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2448  superoxide dismutase  46.2 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0103073  normal  0.0475458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3237  superoxide dismutase  46.88 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  45.9 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  45.9 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  45.9 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  45.9 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  46.2 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  48.63 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>