More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0861 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  83.33 
 
 
200 aa  350  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  80.3 
 
 
200 aa  343  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  80.3 
 
 
200 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  79.29 
 
 
199 aa  336  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  79.29 
 
 
199 aa  335  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  76.26 
 
 
200 aa  326  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  76.26 
 
 
198 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  74.24 
 
 
199 aa  316  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  74.24 
 
 
199 aa  314  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  72.22 
 
 
199 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  72.22 
 
 
199 aa  304  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  72 
 
 
199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  70.2 
 
 
198 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  72 
 
 
199 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  71.5 
 
 
199 aa  299  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  69.7 
 
 
198 aa  298  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  70.2 
 
 
198 aa  297  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  69.7 
 
 
199 aa  295  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  67 
 
 
199 aa  291  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  67.84 
 
 
199 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  65.5 
 
 
199 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  66.16 
 
 
198 aa  283  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  64.14 
 
 
199 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  62 
 
 
201 aa  267  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  53.5 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  53.37 
 
 
197 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  49 
 
 
200 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  49 
 
 
200 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  50.5 
 
 
227 aa  207  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  49.48 
 
 
229 aa  205  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.81 
 
 
199 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  53.81 
 
 
199 aa  204  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  53.3 
 
 
199 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  46.31 
 
 
206 aa  202  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  50 
 
 
199 aa  202  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  53 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  46 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  48.98 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  53.3 
 
 
199 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  45.77 
 
 
200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  50 
 
 
199 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  48.76 
 
 
200 aa  198  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  49.74 
 
 
209 aa  197  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  48.69 
 
 
209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  53.54 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  48.47 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  50.49 
 
 
201 aa  194  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  49.48 
 
 
193 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  50.25 
 
 
198 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  52 
 
 
201 aa  193  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  49.75 
 
 
198 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  50 
 
 
192 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  49.75 
 
 
198 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  49.75 
 
 
198 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  43.78 
 
 
200 aa  191  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  49.75 
 
 
198 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  48.21 
 
 
198 aa  191  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  50.52 
 
 
193 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  50.52 
 
 
233 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  50.52 
 
 
233 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  47.72 
 
 
193 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  47.72 
 
 
193 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  50.52 
 
 
193 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  46.5 
 
 
198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  49.49 
 
 
193 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  45.85 
 
 
204 aa  187  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  50 
 
 
199 aa  187  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0073  Superoxide dismutase  49.23 
 
 
198 aa  187  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  47.29 
 
 
209 aa  187  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  48.47 
 
 
193 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  47.24 
 
 
204 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  47.52 
 
 
203 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  49.49 
 
 
193 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  49.74 
 
 
193 aa  185  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  48.44 
 
 
221 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  48.47 
 
 
193 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  48.44 
 
 
221 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  48.44 
 
 
221 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  49.75 
 
 
193 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  44.78 
 
 
203 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  48.48 
 
 
201 aa  184  9e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  42.79 
 
 
200 aa  184  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  48.44 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  48.44 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  49.48 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  48.44 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  49.48 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4391  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  48.45 
 
 
192 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  44.28 
 
 
203 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>