More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0587 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0587  superoxide dismutase  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0966  Superoxide dismutase  85.5 
 
 		 200 aa  360  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0845  Superoxide dismutase  85.5 
 
 		 200 aa  360  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0566  Fe/Mn family superoxide dismutase  84.92 
 
 		 199 aa  357  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.793926  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0567  Fe/Mn family superoxide dismutase  84.92 
 
 		 199 aa  357  8e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1245  superoxide dismutase  82.5 
 
 		 200 aa  349  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2701  superoxide dismutase  83.84 
 
 		 198 aa  348  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0895268  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0861  manganese and iron superoxide dismutase  83.33 
 
 		 200 aa  323  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0228298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1677  superoxide dismutase  76.38 
 
 		 199 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1890  Superoxide dismutase  74.24 
 
 		 198 aa  314  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0420  superoxide dismutase  74.75 
 
 		 198 aa  314  6e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3621  superoxide dismutase  75.9 
 
 		 198 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.695841  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1335  superoxide dismutase, iron/manganese cofactor  72.86 
 
 		 199 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5305  superoxide dismutase  71.21 
 
 		 199 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0317747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3738  superoxide dismutase  73.98 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.352128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5903  manganese and iron superoxide dismutase  70.85 
 
 		 199 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3319  superoxide dismutase  70.35 
 
 		 198 aa  299  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4497  superoxide dismutase  69.5 
 
 		 199 aa  299  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  71.72 
 
 		 199 aa  298  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  71.72 
 
 		 199 aa  298  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  71.21 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3432  superoxide dismutase  69.7 
 
 		 199 aa  295  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0913  manganese and iron superoxide dismutase  68.66 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.277358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1676  Superoxide dismutase  68.34 
 
 		 199 aa  288  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.15317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1646  superoxide dismutase  66.83 
 
 		 199 aa  288  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.571059  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  54 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0518  superoxide dismutase  55.33 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2693  Fe/Mn family superoxide dismutase  53.81 
 
 		 199 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2189  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.924311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1350  superoxide dismutase  53.3 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.772755  normal  0.0350639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1871  superoxide dismutase  54.73 
 
 		 199 aa  207  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.441148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  51.55 
 
 		 199 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  50.75 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1067  superoxide dismutase  55.05 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  51.53 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  48.26 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  48.26 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  50.78 
 
 		 227 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  48.96 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  50.26 
 
 		 197 aa  202  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0976  superoxide dismutase  54.04 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.665158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0963  manganese and iron superoxide dismutase  49.25 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  52.6 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  46.12 
 
 		 206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  49.49 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  49.74 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  53.65 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  51.55 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  53.65 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  46.5 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1181  superoxide dismutase  53 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  53.03 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  53.3 
 
 		 193 aa  194  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  51.27 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  51.52 
 
 		 193 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  51.52 
 
 		 193 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  50.76 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  49.22 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  51.01 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  51.52 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1129  superoxide dismutase  50.99 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  51.56 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  48.99 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  48.99 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  50.51 
 
 		 193 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  44 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  50.52 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4128  superoxide dismutase  46.5 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.19537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1061  Superoxide dismutase  49.01 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1987  Superoxide dismutase  46.23 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.4562300000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  50.52 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 193 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  52.08 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  48.98 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  50.79 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  51.83 
 
 		 193 aa  188  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  52.08 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  50.79 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  52.08 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 192 aa  188  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1119  superoxide dismutase  48.02 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.387137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  51.56 
 
 		 192 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  52.08 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0108  superoxide dismutase, manganese  48.76 
 
 		 209 aa  187  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  50.52 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  44 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2645  Superoxide dismutase  51.31 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  51.28 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  47 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  47.57 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  51.56 
 
 		 193 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  46.31 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  51.56 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  51.56 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>