61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_92667 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_92667  predicted protein  100 
 
 		 284 aa  570  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000121698  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49387  predicted protein  35.68 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  29.66 
 
 		 441 aa  92.8  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  32.84 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  30.73 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05240  mRNA catabolism, nonsense-mediated-related protein, putative  27.75 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115659  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25 
 
 		 552 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55837  predicted protein  26.06 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.876442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  29.29 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  26.98 
 
 		 477 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  24.19 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33568  predicted protein  26.79 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0922684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02550  conserved hypothetical protein  34.94 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  26.02 
 
 		 572 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  25.46 
 
 		 424 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  33.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  38.98 
 
 		 90 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46145  predicted protein  23.12 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0356931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1603  RNP-1 like RNA-binding protein  29.63 
 
 		 103 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  31.25 
 
 		 115 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  40.28 
 
 		 137 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  23.79 
 
 		 605 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  31.82 
 
 		 160 aa  46.2  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  34.25 
 
 		 95 aa  46.2  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66642  negative growth regulatory protein  25.17 
 
 		 690 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26750  predicted protein  42.86 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  23.94 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  26.26 
 
 		 632 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  31.91 
 
 		 97 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  35.82 
 
 		 105 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  40.68 
 
 		 103 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  32.43 
 
 		 104 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  38.6 
 
 		 76 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1927  RNP-1 like RNA-binding protein  34.44 
 
 		 88 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  33.87 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  36.21 
 
 		 88 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  24.12 
 
 		 1290 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  36.21 
 
 		 90 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  34.72 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  33.9 
 
 		 101 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  31.25 
 
 		 99 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  25.86 
 
 		 732 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84754  predicted protein  24.21 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.345333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  32.2 
 
 		 99 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  35.23 
 
 		 88 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  28.75 
 
 		 102 aa  43.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.26 
 
 		 96 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  37.7 
 
 		 81 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  34.92 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  32.26 
 
 		 82 aa  43.1  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  30.65 
 
 		 90 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 89 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  30.86 
 
 		 116 aa  42.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  30.93 
 
 		 102 aa  42.7  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10941  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein HRP1 (AFU_orthologue; AFUA_2G06090)  23.08 
 
 		 559 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210274  normal  0.500661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  30.93 
 
 		 102 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  32 
 
 		 122 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.18 
 
 		 88 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48602  predicted protein  30.77 
 
 		 582 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  30.65 
 
 		 160 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>