45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2571 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2571  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.352522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3193  hypothetical protein  84.62 
 
 		 260 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4723  hypothetical protein  67.8 
 
 		 259 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4123  hypothetical protein  65.25 
 
 		 257 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1335  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  63.74 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1674  hypothetical protein  71.74 
 
 		 237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1840  hypothetical protein  62.84 
 
 		 260 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0085031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3649  hypothetical protein  40.86 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5406  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  43.39 
 
 		 238 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0191  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  45.95 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0876048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3002  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.4 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2879  hypothetical protein  36.54 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3105  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  36.54 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.170192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3212  hypothetical protein  45.98 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0365  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  44.12 
 
 		 183 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2377  hypothetical protein  42.44 
 
 		 174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.388128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0211  hypothetical protein  37.91 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.730473  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1735  hypothetical protein  32.91 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.9552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0609  chemotaxis protein  37.06 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.147414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1950  hypothetical protein  35.33 
 
 		 440 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4959  hypothetical protein  34.35 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.096287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4931  hypothetical protein  33.82 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2836  hypothetical protein  33.88 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2224  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  35.2 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.659574  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0815  hypothetical protein  34.09 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.872238  normal  0.105867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0884  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.89 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156124  hitchhiker  0.002075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0889  hypothetical protein  32.81 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0849  hypothetical protein  32.81 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0387  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  37.06 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0488  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  33.93 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.531435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0418  chemotaxis protein  31.72 
 
 		 178 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.499236  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0451  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  31.72 
 
 		 178 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.211219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27940  chemotaxis regulator CheZ  36.04 
 
 		 226 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000139196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2148  chemotaxis protein CheZ, putative  25.33 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.992761  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4168  chemotaxis regulator CheZ  31.09 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4056  chemotaxis regulator CheZ  31.09 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0389  putative chemotaxis phosphatase, CheZ  32.98 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3521  chemotaxis regulator CheZ  30.3 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.328014 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1401  chemotaxis regulator CheZ  27.11 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21819  normal  0.433138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0742  chemotaxis regulator CheZ  30.12 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.487627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1759  chemotaxis regulator CheZ  30.3 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1647  chemotaxis regulator CheZ  30.3 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06211  chemotaxis phosphatase CheZ  25.27 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00955  chemotaxis phosphatase CheZ  25.27 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.417483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>