More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0698 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6209  aminotransferase  75.86 
 
 
554 aa  870    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0627315  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4807  aminotransferase class-III  69.56 
 
 
573 aa  760    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.270639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3605  aminotransferase class-III  68.62 
 
 
549 aa  772    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0698  aminotransferase class-III  100 
 
 
554 aa  1143    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.227575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0343  aminotransferase class-III  65.1 
 
 
563 aa  724    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319933  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4623  aminotransferase class-III  68.45 
 
 
569 aa  762    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.89 
 
 
6889 aa  184  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3418  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 
4354 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.696209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  29.07 
 
 
3739 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  31.53 
 
 
2273 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  28.07 
 
 
3099 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  30 
 
 
2684 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  28.54 
 
 
2454 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2666  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.69 
 
 
428 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0598472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  29.7 
 
 
1786 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5749  aminotransferase class-III  27.48 
 
 
483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0337  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.31 
 
 
427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00652219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  28.86 
 
 
2679 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3356  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.32 
 
 
427 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000584172  hitchhiker  0.00810852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  31.3 
 
 
2682 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  29.84 
 
 
1646 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0189  polyketide synthase peptide synthetase fusion protein  31.92 
 
 
3133 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1595  non-ribosomal peptide synthase/polyketide synthase  31.92 
 
 
3148 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1677  non-ribosomal peptide synthase  31.92 
 
 
3157 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  29.22 
 
 
3337 aa  160  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3927  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.96 
 
 
427 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000281902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4011  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.22 
 
 
427 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.49886e-31 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4245  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.2 
 
 
427 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000211848  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1208  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.95 
 
 
432 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1211  polyketide synthase  31.3 
 
 
3044 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.165811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0218  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.5 
 
 
423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0800  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.2 
 
 
425 aa  156  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00716441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0961  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.07 
 
 
428 aa  154  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1237  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.36 
 
 
427 aa  153  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1024  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.81 
 
 
434 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 
2710 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.95 
 
 
427 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.456141  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6505  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.07 
 
 
429 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.211248  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3139  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.25 
 
 
428 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000990553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30 
 
 
3718 aa  150  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3362  amino acid adenylation  29.9 
 
 
2943 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1468  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.36 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.311379  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3180  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.88 
 
 
422 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0731  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.73 
 
 
427 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.415473  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7303  polyketide synthase and peptide synthetase  30.59 
 
 
466 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00650  Glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.39 
 
 
426 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0193  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.13 
 
 
431 aa  145  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2800  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.44 
 
 
431 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.279066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2502  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.31 
 
 
425 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11660  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  32.18 
 
 
429 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.545154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0847  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  28.99 
 
 
428 aa  144  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00900779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0202  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.52 
 
 
431 aa  143  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.518998  normal  0.0385329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2394  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  34.44 
 
 
431 aa  143  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1570  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  33.04 
 
 
426 aa  143  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197478  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1968  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.82 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50966  predicted protein  33.78 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3288  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  33.73 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2530  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.32 
 
 
427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00381454  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  30.73 
 
 
4478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2421  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.5 
 
 
428 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.23384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  29.19 
 
 
3335 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1328  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.1 
 
 
427 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0353724  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0686  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.27 
 
 
426 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00153  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00257803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0224  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.33 
 
 
426 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0223  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.33 
 
 
426 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.01485  normal  0.360359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.33 
 
 
426 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0159  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2747  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  32.65 
 
 
452 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0161  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.97 
 
 
433 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00152  hypothetical protein  29.07 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3505  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 
426 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0155655  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0221  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.33 
 
 
426 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00426685  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1131  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.2 
 
 
427 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2038  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.12 
 
 
431 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.251047  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0158  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 
426 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0239  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.37 
 
 
426 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00212628  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0171  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  31.66 
 
 
433 aa  139  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3448  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.33 
 
 
426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0166  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.07 
 
 
426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1109  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.74 
 
 
430 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12390  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.81 
 
 
427 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2557  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.52 
 
 
431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.543166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1914  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.76 
 
 
428 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0164  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.8 
 
 
426 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  29.26 
 
 
2176 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4342  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.42 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2017  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  29.8 
 
 
423 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0031552  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0146  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.53 
 
 
426 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2664  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  32.6 
 
 
428 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.940231  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1227  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.69 
 
 
422 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000806301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0054  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.95 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0827  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.38 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.215136  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3304  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  33.33 
 
 
429 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1975  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  30.83 
 
 
439 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1229  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  26.96 
 
 
432 aa  134  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00808664  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1608  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  30.1 
 
 
433 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1789  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  28.69 
 
 
426 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.507749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2811  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  29.61 
 
 
426 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1201  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  30.32 
 
 
426 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0421801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>