46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2455 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2455  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  353  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.58524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22250  hypothetical protein  47.56 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1650  hypothetical protein  51.7 
 
 		 210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6582  hypothetical protein  46.96 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.727924  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1334  putative uridine kinase  47.27 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.819604  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1119  hypothetical protein  45.16 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2365  hypothetical protein  46.11 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.651738  decreased coverage  0.00293755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5271  hypothetical protein  43.27 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5360  hypothetical protein  43.27 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5650  hypothetical protein  43.27 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1924  hypothetical protein  39.64 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4667  hypothetical protein  36.76 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.0238541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0969  hypothetical protein  41.56 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2973  hypothetical protein  41.88 
 
 		 195 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3927  hypothetical protein  41.85 
 
 		 340 aa  98.6  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.415974  decreased coverage  0.00805861 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  32.95 
 
 		 198 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.71 
 
 		 719 aa  97.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3552  hypothetical protein  42.11 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3848  anthranilate synthase, component II / anthranilate synthase, component I  36.08 
 
 		 682 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  30.34 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36540  uridine kinase  40.23 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.36252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  28.74 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0204  hypothetical protein  38.61 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  32.78 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18880  hypothetical protein  37.65 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.279891  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  31.58 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4007  hypothetical protein  32.14 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2856  hypothetical protein  33.14 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0439  hypothetical protein  35.58 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0338  hypothetical protein  37.8 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.912802  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12820  hypothetical protein  36.08 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270061  decreased coverage  0.00529228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  32.14 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2258  hypothetical protein  28.74 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2374  hypothetical protein  28.74 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0044  uridine kinase  29.81 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  30.09 
 
 		 550 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  25.14 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1166  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01961  hypothetical protein  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3003  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.384394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01972  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0994  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1575  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2359  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2206  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1591  uridine kinase  27.57 
 
 		 213 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>