31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1899 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  296  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  64.79 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  48.46 
 
 		 194 aa  94.4  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  57.65 
 
 		 176 aa  90.5  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  61.97 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  53.42 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  58.89 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  37.17 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  57.14 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  55.95 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  55.95 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  55.95 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  34.27 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  34.23 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  47.83 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  46.38 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  44.76 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  39.22 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  41.56 
 
 		 212 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  46.48 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0837  TM2 domain-containing protein  48.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  42.47 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  41.27 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  65.79 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0353  hypothetical protein  43.28 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000372967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.33 
 
 		 2272 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  38.89 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  28.32 
 
 		 2179 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0382  hypothetical protein  43.48 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 499 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>