26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1682 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  42.27 
 
 		 343 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  48.51 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  32.57 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  63.64 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  46.36 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  33.58 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  45.26 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  27.54 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  25.72 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  27 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  43.75 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  44.44 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  48.98 
 
 		 349 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  25.1 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  37.21 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  25.61 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  40.23 
 
 		 302 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  21.76 
 
 		 298 aa  48.9  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  36.49 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  40.23 
 
 		 309 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  24.19 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  27.71 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  19.66 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  24.43 
 
 		 359 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  24.15 
 
 		 328 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>