189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1309 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1309  NUDIX hydrolase  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 
159 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
160 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  46.34 
 
 
152 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
156 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
157 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  47.11 
 
 
162 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
156 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
162 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  46.49 
 
 
163 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  52.29 
 
 
161 aa  97.8  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  40.35 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  34 
 
 
229 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  33 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  33 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  32 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  30.71 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  32.08 
 
 
156 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  32 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  36.56 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  29.35 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.36 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  32.41 
 
 
212 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
141 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  28.26 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  34 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2524  MutT/nudix family protein  32.14 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.921198  hitchhiker  0.00375744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  38.04 
 
 
530 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  27.17 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  35.11 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  30.7 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.2 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
169 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.93 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 
161 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 
161 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
149 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
149 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.27 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  34.51 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
314 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  34.48 
 
 
181 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  28 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  28 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  31.68 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
294 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  32.04 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.82 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>