More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0346 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  50.77 
 
 		 652 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  50.77 
 
 		 652 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  49.69 
 
 		 652 aa  636    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  52.49 
 
 		 653 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 		 644 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.58 
 
 		 662 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  69.42 
 
 		 715 aa  955    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  51.64 
 
 		 644 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  50.85 
 
 		 649 aa  638    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 651 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  49.77 
 
 		 650 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  53.5 
 
 		 651 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  53.77 
 
 		 651 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 		 653 aa  651    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  68.78 
 
 		 656 aa  949    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.8 
 
 		 658 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3488  acetate--CoA ligase  58.78 
 
 		 656 aa  753    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 		 655 aa  679    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  52.31 
 
 		 652 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  57.57 
 
 		 657 aa  753    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  52.94 
 
 		 657 aa  699    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  50.61 
 
 		 651 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 		 666 aa  912    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  51.6 
 
 		 645 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  51.06 
 
 		 660 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 		 667 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.19 
 
 		 673 aa  731    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  52.59 
 
 		 666 aa  706    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  56.5 
 
 		 657 aa  718    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  56.6 
 
 		 658 aa  739    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  53.38 
 
 		 661 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.41 
 
 		 653 aa  707    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  53.1 
 
 		 660 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  55.49 
 
 		 656 aa  731    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  52.37 
 
 		 646 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  51.28 
 
 		 660 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 		 650 aa  639    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3663  acetyl-coenzyme A synthetase  54.3 
 
 		 667 aa  680    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  51.07 
 
 		 652 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  51.69 
 
 		 649 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.34 
 
 		 658 aa  718    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.65 
 
 		 660 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1331  acetate--CoA ligase  50.93 
 
 		 647 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000184836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  50.31 
 
 		 647 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  49.55 
 
 		 654 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  55.86 
 
 		 656 aa  739    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  51.13 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 		 652 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  55.01 
 
 		 649 aa  743    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  52.3 
 
 		 650 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  51.52 
 
 		 649 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4627  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 651 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369065  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0415  acetate--CoA ligase  68.37 
 
 		 654 aa  880    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0163435  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.21 
 
 		 660 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  58.73 
 
 		 652 aa  749    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  55.56 
 
 		 655 aa  709    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3194  acetyl-CoA synthetase  53.34 
 
 		 649 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.1 
 
 		 660 aa  712    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  49.38 
 
 		 652 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  50.83 
 
 		 650 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 		 660 aa  912    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  56.31 
 
 		 644 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  51.26 
 
 		 654 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.56 
 
 		 655 aa  748    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 650 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 650 aa  635    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  50.61 
 
 		 645 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 		 660 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  51.66 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  51.36 
 
 		 660 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.36 
 
 		 664 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  52.07 
 
 		 651 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  52.13 
 
 		 651 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0533  acetyl-coenzyme A synthetase  53.79 
 
 		 670 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1759  acetyl-coenzyme A synthetase  66.21 
 
 		 673 aa  835    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3378  acetyl-coenzyme A synthetase  66.22 
 
 		 676 aa  865    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.450372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4567  acetyl-CoA synthetase  51.46 
 
 		 644 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1428  acetyl-CoA synthetase  52.49 
 
 		 653 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0956838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1748  acetyl-CoA synthetase  50.53 
 
 		 650 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  51.13 
 
 		 670 aa  668    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  48.96 
 
 		 660 aa  650    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  52.77 
 
 		 661 aa  677    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 		 650 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  52.5 
 
 		 656 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  54.49 
 
 		 644 aa  668    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1092  acetyl-CoA synthetase  52.65 
 
 		 651 aa  651    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.750983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  67.72 
 
 		 657 aa  910    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  52.66 
 
 		 667 aa  699    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  52.39 
 
 		 638 aa  638    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0346  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1352    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 		 650 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13698  acetyl-CoA synthetase  63.98 
 
 		 651 aa  835    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.037981 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  67.55 
 
 		 660 aa  912    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  65.68 
 
 		 653 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>