85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0327 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  43.23 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  45.11 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  41.61 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  33.94 
 
 
176 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  34.88 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  33.85 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  34.18 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  30.52 
 
 
159 aa  90.5  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  87  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  32.62 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  26.95 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  32.85 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  33.86 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  33.86 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  27.85 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  27.67 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  28.76 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  27.69 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
269 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  29.77 
 
 
278 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 
278 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
269 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  35.38 
 
 
278 aa  53.9  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  30.89 
 
 
278 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  30.93 
 
 
271 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
278 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  28.43 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  30.53 
 
 
269 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  25.66 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
174 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  31.19 
 
 
332 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  29.17 
 
 
279 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  28.99 
 
 
278 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3733  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
262 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.919007  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1788  Redoxin domain protein  34.52 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  29.03 
 
 
268 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  25.81 
 
 
269 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  28.26 
 
 
278 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  28.85 
 
 
269 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  36.96 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.79 
 
 
272 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  36.96 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.33 
 
 
206 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  30.99 
 
 
290 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  30.43 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  39.22 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  26.09 
 
 
194 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.35 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  26.09 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1975  thioredoxin-like protein  24.24 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  25.22 
 
 
194 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.35 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00100  putative thiol:disulfide interchange protein  24 
 
 
277 aa  44.3  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  25.22 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
278 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  25.22 
 
 
194 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  28.21 
 
 
266 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  25.68 
 
 
159 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  31.91 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  35.62 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  28.12 
 
 
267 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  25 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  35.06 
 
 
226 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  23.53 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1412  Redoxin domain protein  25.37 
 
 
263 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2433  redoxin domain-containing protein  25.37 
 
 
277 aa  41.2  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  26.4 
 
 
279 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  31.11 
 
 
270 aa  41.2  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.19 
 
 
173 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  32.56 
 
 
222 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  23.39 
 
 
196 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  48.78 
 
 
270 aa  40.8  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>