More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1146 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
697 aa  1441    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2637  sulfite reductase (NADPH)  34.37 
 
 
713 aa  333  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.84 
 
 
757 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6617  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.88 
 
 
704 aa  320  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00459026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3092  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.26 
 
 
697 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000117991  hitchhiker  0.00929399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.89 
 
 
720 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2618  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.17 
 
 
742 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1504  sulfite reductase (ferredoxin)  35.67 
 
 
696 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3268  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.04 
 
 
606 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.446029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3346  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  35.58 
 
 
605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4432  ferredoxin--nitrite reductase  33.58 
 
 
607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5531  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.39 
 
 
609 aa  266  8.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0679  sulfite reductase ferredoxin  31.24 
 
 
602 aa  265  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3155  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  34.93 
 
 
606 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3604  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  33.72 
 
 
614 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387306  normal  0.13043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  31.07 
 
 
552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  30.75 
 
 
548 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  31.16 
 
 
551 aa  234  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  30.36 
 
 
550 aa  227  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.91 
 
 
551 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  31.06 
 
 
551 aa  223  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.81 
 
 
550 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  30.28 
 
 
550 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  30.31 
 
 
542 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  30.09 
 
 
550 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  30.09 
 
 
550 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.78 
 
 
551 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.61 
 
 
557 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  29.41 
 
 
550 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.63 
 
 
550 aa  219  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  29.74 
 
 
552 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  29.55 
 
 
552 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  29.55 
 
 
796 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.3 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  30.45 
 
 
557 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  28.68 
 
 
553 aa  214  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  30.11 
 
 
669 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  30.02 
 
 
552 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  29.89 
 
 
557 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  32.1 
 
 
639 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  28.78 
 
 
552 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  28.91 
 
 
552 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.8 
 
 
550 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  29.91 
 
 
543 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.41 
 
 
557 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.33 
 
 
552 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1110  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.73 
 
 
560 aa  208  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.02 
 
 
551 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.16 
 
 
553 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.62 
 
 
552 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.09 
 
 
553 aa  207  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.55 
 
 
556 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  29.55 
 
 
556 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.86 
 
 
551 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  29.46 
 
 
544 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  29.86 
 
 
569 aa  205  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.42 
 
 
560 aa  205  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28.36 
 
 
551 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  33.19 
 
 
643 aa  204  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.39 
 
 
555 aa  204  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.48 
 
 
564 aa  203  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.36 
 
 
562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.07 
 
 
550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0512  nitrite/sulfite reductase-like protein  28.63 
 
 
516 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  30.36 
 
 
560 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  29.53 
 
 
556 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.3 
 
 
558 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  29.35 
 
 
553 aa  201  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.05 
 
 
565 aa  201  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  29.22 
 
 
559 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  28.83 
 
 
564 aa  200  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.99 
 
 
793 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  31.54 
 
 
521 aa  199  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.84 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  29.64 
 
 
586 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  28.8 
 
 
560 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.02 
 
 
556 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  29.32 
 
 
569 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  29.61 
 
 
554 aa  197  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.21 
 
 
544 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29.3 
 
 
560 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  31.43 
 
 
648 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  29.46 
 
 
568 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  28.7 
 
 
559 aa  195  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  28.52 
 
 
559 aa  195  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  29.21 
 
 
559 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.6 
 
 
568 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  29.21 
 
 
559 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.21 
 
 
559 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  29.03 
 
 
559 aa  194  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  29.75 
 
 
569 aa  193  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  28.89 
 
 
559 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.99 
 
 
570 aa  193  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.21 
 
 
559 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  28.71 
 
 
589 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1068  putative sulfite reductase, beta subunit  26.7 
 
 
561 aa  192  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1394  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.84 
 
 
561 aa  192  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.55 
 
 
569 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  28.57 
 
 
559 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  28.65 
 
 
559 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>