30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1199 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1085    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  39.64 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  23.7 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24.21 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  20.68 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  23.14 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  25.43 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  23.64 
 
 		 335 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  21.99 
 
 		 349 aa  57  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  21 
 
 		 291 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  23.94 
 
 		 326 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  25.15 
 
 		 296 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  20.25 
 
 		 331 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  25.41 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  22.82 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  30.56 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  25.45 
 
 		 316 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  20.31 
 
 		 294 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  25.33 
 
 		 368 aa  47  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  21.7 
 
 		 328 aa  47  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  25 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  25.45 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  23.68 
 
 		 657 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  23.08 
 
 		 326 aa  44.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>