More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3767 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3767  threonine dehydratase  100 
 
 		 426 aa  828    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.826311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2937  threonine dehydratase  81.88 
 
 		 418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.39 
 
 		 403 aa  302  6.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  44.42 
 
 		 403 aa  300  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 403 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.26 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  38.81 
 
 		 404 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.45 
 
 		 403 aa  278  9e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  45.55 
 
 		 403 aa  276  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  39.65 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  44.91 
 
 		 403 aa  269  8e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  43.16 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  39.41 
 
 		 401 aa  263  6e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 402 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  45.14 
 
 		 414 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  45.96 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.6 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  44 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  37 
 
 		 403 aa  253  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 401 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  36.08 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.82 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  44.85 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.05 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.43 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  35.79 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  43.82 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.38 
 
 		 406 aa  247  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  40.55 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  42.56 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  46.95 
 
 		 418 aa  243  7e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.66 
 
 		 415 aa  242  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  39.21 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  38.63 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  39.7 
 
 		 412 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  43.22 
 
 		 401 aa  236  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  42.99 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  47.56 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  40.44 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  34.25 
 
 		 406 aa  233  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  39.18 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.89 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.77 
 
 		 332 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.62 
 
 		 338 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.9 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0305  serine/threonine dehydratase  44.94 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333559 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  39.21 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.95 
 
 		 320 aa  226  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 403 aa  226  8e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 405 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  40.25 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  41.63 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  42.18 
 
 		 346 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  42.18 
 
 		 346 aa  224  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  37.31 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  43.45 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  47.02 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.73 
 
 		 408 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  41.33 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  38.1 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  40.59 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  38.11 
 
 		 511 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  47.08 
 
 		 333 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  46.43 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  46.43 
 
 		 333 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  41.65 
 
 		 404 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  46.43 
 
 		 333 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  46.75 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  37.8 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  46.43 
 
 		 333 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  41.31 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  39.11 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  40.25 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  40.55 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.07 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  40.39 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>