41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2481 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2481  phage terminase, small subunit, putative, P27  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0286  P27 family phage terminase small subunit  40.58 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5450  hypothetical protein  44.96 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1473  phage terminase, small subunit, putative, P27  44.63 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.889427  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1369  P27 family phage terminase small subunit  38.41 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.369715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1617  phage terminase, small subunit, putative, P27  43.8 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207143  normal  0.415042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3988  phage terminase, small subunit, , P27 family  42.19 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1724  phage terminase, small subunit, putative, P27  32.76 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0622  phage terminase, small subunit, , P27 family  36.63 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2620  phage terminase, small subunit, putative, P27 family  33.65 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0334  phage terminase, small subunit, putative, P27  32.48 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2021  phage terminase, small subunit, putative, P27  32.48 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1588  putative phage terminase, small subunit  33.62 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0296354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0871  Phage terminase protein  31.67 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1454  phage terminase, small subunit, , P27 family  36.36 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7138  P27 family phage terminase small subunit  30.28 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1723  P27 family phage terminase small subunit  29.6 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000117045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0669  P27 family phage terminase small subunit  27.37 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2353  hypothetical protein  34.38 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2064  P27 family phage terminase small subunit  26.27 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145671 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1320  P27 family phage terminase small subunit  28.07 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000502965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0839  phage terminase, small subunit, putative, P27  28.07 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00189834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3265  phage terminase, small subunit, P27 family  32.38 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.757677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0871  P27 family phage terminase small subunit  23.89 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.831198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5504  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.97 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4249  phage terminase, small subunit, , P27 family  28.71 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0646  P27 family phage terminase small subunit  31.13 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.646797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2470  phage terminase, small subunit, , P27 family  25 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0465  phage terminase, small subunit  27.91 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.371651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2603  P27 family phage terminase small subunit  27.93 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1651  hypothetical protein  29.03 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3882  phage terminase, small subunit, putative  22.69 
 
 		 155 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.686092  hitchhiker  0.00346128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1288  P27 family phage terminase small subunit  28.57 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4461  putative phage terminase, small subunit, P27 family  24.56 
 
 		 154 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7333  phage terminase, small subunit, , P27 family  29.52 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0016  phage terminase, small subunit, P27 family  25.97 
 
 		 173 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1678  P27 family phage terminase small subunit  27.84 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2968  phage terminase small subunit  22.79 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12668  phiRv2 prophage protein  28.33 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2597  phage terminase, small subunit, , P27 family  23.19 
 
 		 170 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115209  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1185  P27 family phage terminase small subunit  22.43 
 
 		 160 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  hitchhiker  0.000000000518622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>