More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1794 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1794  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
217 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1773  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  85.25 
 
 
217 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0590351  decreased coverage  0.00392698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2521  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  73.49 
 
 
216 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0652814  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4410  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  72.43 
 
 
215 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2782  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  69.67 
 
 
217 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2737  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  71.09 
 
 
217 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45151  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3179  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  69.44 
 
 
217 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.76 
 
 
222 aa  197  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4414  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.2 
 
 
219 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3113  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.04 
 
 
218 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2137  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.64 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.201933  normal  0.500345 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2730  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.8 
 
 
216 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
232 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.18 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1792  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.66 
 
 
215 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  0.0332826 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1768  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.12 
 
 
219 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.597766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.45 
 
 
208 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
208 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.83 
 
 
223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1903  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.6 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.486283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.64 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.7 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.95 
 
 
233 aa  161  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.94 
 
 
208 aa  161  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.6 
 
 
220 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.91 
 
 
219 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.43 
 
 
208 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1204  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.6 
 
 
219 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2544  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.6 
 
 
219 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.24 
 
 
219 aa  158  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  45.92 
 
 
208 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.18 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.88 
 
 
211 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.1 
 
 
211 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.73 
 
 
219 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
211 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0836  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.33 
 
 
226 aa  155  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214261  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.9 
 
 
211 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.93 
 
 
667 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
211 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.62 
 
 
208 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
211 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.13 
 
 
211 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1546  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.57 
 
 
219 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2075  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.79 
 
 
212 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.113018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.24 
 
 
225 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.98 
 
 
211 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.33 
 
 
211 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4054  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.83 
 
 
225 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.617904  hitchhiker  0.00000246992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.75 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.9 
 
 
215 aa  151  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
211 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.79 
 
 
231 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.56 
 
 
211 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.73 
 
 
219 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.79 
 
 
224 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.79 
 
 
224 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.1 
 
 
216 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.94 
 
 
221 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.31 
 
 
236 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.68 
 
 
206 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.68 
 
 
206 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.39 
 
 
218 aa  148  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.1 
 
 
208 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.31 
 
 
211 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
218 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.23 
 
 
217 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0261  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.03 
 
 
225 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.88 
 
 
660 aa  147  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0186  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40 
 
 
428 aa  147  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000467688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.69 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3861  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.64 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2700  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  44.71 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0845  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.36 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.935513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.24 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.54 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.67 
 
 
247 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.41 
 
 
224 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.15 
 
 
216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  43.88 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3023  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.88 
 
 
224 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03724  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.13 
 
 
211 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.32477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.37 
 
 
222 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>