63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0407 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  84.46 
 
 		 278 aa  440  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  73.47 
 
 		 278 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  71.84 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  68.2 
 
 		 246 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  69.64 
 
 		 251 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  69.6 
 
 		 251 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  45.54 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  48.66 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  49.11 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  44.84 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  40.83 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  45.07 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  40.83 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  35 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  32.75 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  40 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  33.48 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  39.8 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  37.9 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  34.75 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  40.74 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  37.33 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  41.78 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  40.2 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  36.44 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  37.82 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  37.82 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  35.85 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  38.98 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  38.12 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  36.74 
 
 		 208 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  38.12 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  33.65 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  38.67 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  36.67 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  32.46 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  33.33 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  34.35 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  34.72 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  35.16 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  37.37 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  33.14 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  31.82 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  32.22 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  31.64 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  33.63 
 
 		 248 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  31.55 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  42.24 
 
 		 160 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  32.57 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  32.57 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  32.57 
 
 		 303 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  32.57 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  32.57 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  32.57 
 
 		 274 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  30.57 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  28.32 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  37.72 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  26.18 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  26.7 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  32.19 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  40.24 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>