37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5384 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5384  DoxX family protein  100 
 
 		 137 aa  259  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.901088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3783  membrane protein-like protein  38.13 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00217188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6952  hypothetical protein  57.5 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0849  hypothetical protein  46.46 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36420  predicted membrane protein  43.88 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0138  hypothetical protein  43.93 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09920  predicted membrane protein  51.43 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.728497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1137  membrane protein  46.36 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.396168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6239  hypothetical protein  46.08 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000127344  normal  0.694726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5051  hypothetical protein  39.45 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1803  hypothetical protein  40.68 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0443122  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1423  hypothetical protein  41.44 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1405  hypothetical protein  41.44 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.78031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4664  hypothetical protein  41.59 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.592546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07620  hypothetical protein  46.9 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.196696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2150  membrane protein-like  48.72 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0271562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4296  DoxX family protein  37.72 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.170558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1459  hypothetical protein  41.28 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.340205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2333  membrane protein-like protein  39.09 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4122  membrane protein-like protein  31.36 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1742  hypothetical protein  35.4 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2209  hypothetical protein  32.43 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2171  membrane protein-like protein  32.43 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06260  predicted membrane protein  45.22 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1317  hypothetical protein  31.03 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000855908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3270  hypothetical protein  35.34 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2365  membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07520  hypothetical protein  29.52 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.984561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1635  DoxX family protein  32.46 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.364562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0969  hypothetical protein  32.94 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1950  hypothetical protein  43.42 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2315  hypothetical protein  34.44 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.20145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2311  hypothetical protein  38.89 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3456  membrane protein  37.04 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4384  membrane protein-like protein  38.67 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3912  membrane protein-like protein  34.48 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0622055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3443  hypothetical protein  38.81 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.1066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>