66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4285 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  29.3 
 
 
306 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  29.3 
 
 
313 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  34.63 
 
 
272 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  32.05 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  26.95 
 
 
303 aa  89.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  31.46 
 
 
334 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  31.85 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  28.18 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  33.33 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  31.23 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  33.33 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  30 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  28.51 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  25.91 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  32.16 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  27.98 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  27.07 
 
 
269 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  31.08 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  42.57 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  30.25 
 
 
284 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  30.96 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  32.08 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  28.99 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  34.26 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  28.32 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  32.67 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  36.54 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  24.58 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  31.58 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  28.82 
 
 
193 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  32.63 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  27.15 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  31.27 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  30.11 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  30.11 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  30.11 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
277 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  31.52 
 
 
277 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  52.38 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  31.52 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  33.33 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  27.21 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  30.61 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  22.86 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  30.11 
 
 
278 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  36.21 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  32.56 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  38.06 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  26.79 
 
 
291 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  33.58 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  33.65 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  26.92 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  34.08 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  26.29 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  29.95 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  28.16 
 
 
445 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  32.97 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  31.48 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  29.95 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  34.51 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  37.08 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  30.06 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  34 
 
 
311 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  33.33 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>