59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1073 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  100 
 
 
274 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  54.21 
 
 
281 aa  317  9e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  60.23 
 
 
262 aa  308  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  52.14 
 
 
287 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  37.17 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  35.8 
 
 
264 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  33.05 
 
 
285 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  31.17 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  30.8 
 
 
303 aa  95.5  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  30.3 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  26.89 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  31.82 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  26.89 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  30.74 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  32.22 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  30.25 
 
 
315 aa  82  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  31.75 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  29.61 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  31.75 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  24.62 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  28.63 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  26.32 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  46.07 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  32.43 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  30.32 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  32.43 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  32.43 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  28.87 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  32.43 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  32.21 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  31.54 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  30.46 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  27.17 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  38 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  30.87 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  38.66 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  31.88 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  30.3 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  27.72 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  27.57 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  25.14 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  32.91 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  38.46 
 
 
279 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  25.57 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  34.12 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  44.07 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1137  hypothetical protein  23.43 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.918548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  50 
 
 
310 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  35.42 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  40.38 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  35.45 
 
 
304 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  28.24 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  29 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  35.64 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2862  CAAX amino terminal protease family protein  25.33 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000124869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3477  abortive infection protein  25.44 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2815  CAAX amino terminal protease family protein  25.33 
 
 
288 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000895449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2573  CAAX amino protease  25.33 
 
 
288 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000633409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2624  CAAX amino terminal protease family protein  25.33 
 
 
288 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000361529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>