62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1918 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  100 
 
 		 274 aa  524  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  70.41 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  32.88 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  28.11 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  28.11 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  26.15 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  31.88 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  28.83 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  28.68 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  30.68 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  29.57 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  27.94 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  30.5 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  32.14 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  28.32 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  31.94 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  27.51 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  30.18 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  30.81 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  28.21 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  23.89 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  26.87 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  28.87 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  30.37 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  31.13 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  30.77 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  26.67 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  33.33 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  31.53 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  27.43 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  31.11 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  23.2 
 
 		 345 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  29.17 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3051  caax amino protease family  28.45 
 
 		 211 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  27.52 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  24.54 
 
 		 317 aa  48.9  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  30.83 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3235  abortive infection protein  28.82 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  29.7 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  22.89 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  30.91 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  30.91 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  42.86 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  27.95 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  33.71 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  52.63 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  40.35 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  27.62 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  27.62 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  45 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  27.62 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  45 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  45 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  45 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  34.07 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  45 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  25.32 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  28.32 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0673  abortive infection protein  26.96 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  32.61 
 
 		 445 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  27.59 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>