44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1619 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1638  hypothetical protein  33.6 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  32.58 
 
 
284 aa  89  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  31.56 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  30.48 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  34.03 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  30.17 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  28.02 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  26.61 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  40.91 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  34.31 
 
 
263 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  24.58 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  28.38 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  33.96 
 
 
345 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  28.21 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  29.14 
 
 
262 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  28.37 
 
 
253 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  25.56 
 
 
310 aa  56.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  29.01 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  24.58 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  24.44 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  28.16 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  27.4 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  27.4 
 
 
278 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  24.8 
 
 
296 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  28.16 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  33.06 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  28.75 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  25.93 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  26.95 
 
 
193 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  24.86 
 
 
286 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  33.33 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  26.15 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  21.83 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  43.24 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  43.24 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  43.24 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  27.17 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  43.24 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  21.83 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  27.59 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  33.71 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  27.48 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  25.93 
 
 
267 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>