65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2103 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  100 
 
 
264 aa  508  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  57.2 
 
 
269 aa  287  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  36.46 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  35.44 
 
 
334 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  36.04 
 
 
262 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  35.43 
 
 
286 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  36.96 
 
 
281 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  31.3 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  33.62 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  30.17 
 
 
339 aa  96.3  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
313 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  31.25 
 
 
306 aa  95.5  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  27.97 
 
 
283 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  34.84 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  30.51 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  31.53 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  25 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  30.48 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  37.78 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  38.46 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  38.33 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  27.31 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  30.14 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  31.55 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  32.16 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  37.4 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  34.43 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  30.57 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  33.81 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  30.38 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  29.71 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  33.61 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  33.61 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  33.61 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  33.61 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  27.31 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0799  Abortive infection protein  28.73 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  32.26 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3477  abortive infection protein  30.68 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1638  hypothetical protein  31.53 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  27.21 
 
 
278 aa  53.5  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  38.1 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  26.64 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  25.53 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  26.29 
 
 
306 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  26.38 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  26.8 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  26.8 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  26.04 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  26.8 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  38.03 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0284  hypothetical protein  32.59 
 
 
265 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  26.97 
 
 
267 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  33.68 
 
 
336 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  34.09 
 
 
301 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  47.06 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  37.36 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  31.91 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  38.67 
 
 
445 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  50 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  38.6 
 
 
279 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  35.04 
 
 
304 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  28.22 
 
 
288 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  27.2 
 
 
295 aa  42  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>