66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2045 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  588  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  30.3 
 
 
267 aa  136  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  26.88 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  30.46 
 
 
284 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  27.23 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  25.62 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  27.74 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  27.91 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  26.47 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  31 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  24.58 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  25.32 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1638  hypothetical protein  23.7 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  35.19 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  22.68 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  23.4 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  24.82 
 
 
253 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  33.64 
 
 
334 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  32.26 
 
 
264 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  26.9 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  24.65 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  26.43 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  31.97 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  27.21 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  25.51 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  23.63 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  26.53 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  28.06 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  25.4 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  28.93 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  42 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  42 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  42 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  42 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  42 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  39.62 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  31.82 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  24.85 
 
 
445 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  29.51 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  37.88 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  28.93 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  28.93 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  35.64 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  32.65 
 
 
246 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  26.79 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  32.26 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  45.95 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  31.96 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  40.43 
 
 
301 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  32 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  31.87 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  23.4 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  27.46 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  47.5 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  41.67 
 
 
279 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  27.97 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  30.1 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  33.96 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  34.67 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2862  CAAX amino terminal protease family protein  27.27 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000124869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3974  abortive infection protein  29.19 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3051  caax amino protease family  38.78 
 
 
211 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2573  CAAX amino protease  27.54 
 
 
288 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000633409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2624  CAAX amino terminal protease family protein  26.95 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000361529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2822  CAAX amino terminal protease family protein  26.95 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000414877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2815  CAAX amino terminal protease family protein  26.95 
 
 
288 aa  42.4  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000895449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>