52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05840 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 		 315 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  58.24 
 
 		 334 aa  305  7e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  52.26 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  29.93 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  29.93 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  32.07 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  34.04 
 
 		 264 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  31.4 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  31.87 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  32.52 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  28.15 
 
 		 339 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  30.42 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  34.63 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  32.77 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  31.36 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  30.89 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  26.79 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  30.95 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  38.33 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  32.39 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  28.95 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0799  Abortive infection protein  34.13 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  36 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  26.92 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  30.73 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  37.76 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  27.4 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  28.57 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  29.28 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  27.74 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  28.17 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3477  abortive infection protein  30.8 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  32.95 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  54.76 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  32.95 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  54.76 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  29.58 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  24.64 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  24 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  32.17 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  36.08 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  27.38 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  53.66 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  28.71 
 
 		 254 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  31.11 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  26.75 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  24.32 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  34.09 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  31.31 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  32.73 
 
 		 316 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>