37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1274 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  100 
 
 
316 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  54.75 
 
 
307 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  40.84 
 
 
445 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  38.11 
 
 
304 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  37.07 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  36.31 
 
 
288 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  34.48 
 
 
279 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  38.46 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  27.5 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  30.18 
 
 
301 aa  86.3  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  31.05 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  30.63 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  33.56 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  35.34 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  32.68 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  36.67 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  31.2 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  35.53 
 
 
293 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  37.82 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  32.73 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  35 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  31.58 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  28.52 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  28.52 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  28.52 
 
 
300 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  22.27 
 
 
278 aa  55.8  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  29.71 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  37.06 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  35.51 
 
 
345 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  35.66 
 
 
311 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  26.72 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  28 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3329  hypothetical protein  31.54 
 
 
270 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  32.73 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  31.17 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  28.69 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  31.25 
 
 
310 aa  42.7  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>