40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1573 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 251 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  40.41 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  39.74 
 
 		 301 aa  201  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  38.49 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  37.8 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  40 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  37.06 
 
 		 307 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  41.67 
 
 		 304 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  34.45 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  30.84 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  43 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  33.7 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  31.87 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  30.83 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  40.18 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  41.41 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  32.54 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  32.54 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  30.65 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  41.35 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  29.61 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  42.27 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  30.77 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  40.37 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  30.37 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3051  caax amino protease family  34 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  30.69 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  38.68 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  31.54 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  36.61 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  32.24 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  32.24 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  32.24 
 
 		 300 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  29.9 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  25.94 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  37.76 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  36.26 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  34.44 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  35.16 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3235  abortive infection protein  34.78 
 
 		 233 aa  42.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>