23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5908 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  100 
 
 
291 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  75.67 
 
 
295 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  66.78 
 
 
300 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  66.78 
 
 
300 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  66.78 
 
 
300 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  39.13 
 
 
286 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  26.63 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  26.04 
 
 
264 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  28.04 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  26.02 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  32.11 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  31.11 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  36.61 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  25 
 
 
297 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  21.81 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  33.02 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  32.38 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  34.23 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  27.23 
 
 
269 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1137  hypothetical protein  23.98 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.918548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3329  hypothetical protein  34.38 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  45.1 
 
 
345 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  30.58 
 
 
297 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>