40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3338 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  100 
 
 
300 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  100 
 
 
300 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  100 
 
 
300 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  66.78 
 
 
291 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  66.91 
 
 
295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  40.52 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  30.59 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  30.59 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  30.08 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  28.94 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  27.8 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  30.94 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  29.27 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  27.14 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  26.47 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  27.04 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3974  abortive infection protein  25.31 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  33.33 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  32.41 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  28.11 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  36.04 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3329  hypothetical protein  30.61 
 
 
270 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2862  CAAX amino terminal protease family protein  24.89 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000124869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  27.34 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  28.16 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  26.64 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  25.55 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  30.11 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2573  CAAX amino protease  25.21 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000633409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2624  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000361529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2815  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000895449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2822  CAAX amino terminal protease family protein  25.27 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000414877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2540  CAAX amino protease  24.47 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000314156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  22.89 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  31.86 
 
 
301 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  31.41 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1137  hypothetical protein  27.06 
 
 
283 aa  43.5  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.918548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  26.18 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  26.58 
 
 
334 aa  42.4  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  28.83 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>