23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3329 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3329  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  33.8 
 
 
310 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  28.63 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  29.61 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  28.25 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  26.91 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  27.66 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  28.57 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  33.98 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  33.16 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  33.81 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  30.61 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  30.61 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  30.61 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  35.61 
 
 
307 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  35.42 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  27.78 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  30.82 
 
 
445 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  31.65 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  21.86 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  30 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  34.38 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  32.26 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>