65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1444 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  869    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  64.45 
 
 
304 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  45.54 
 
 
313 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  40.19 
 
 
316 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  39.81 
 
 
307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  45.32 
 
 
301 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  29.14 
 
 
301 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  34.98 
 
 
336 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  32.82 
 
 
288 aa  96.7  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  35.55 
 
 
310 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  35.62 
 
 
317 aa  95.5  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  36.49 
 
 
319 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  28.82 
 
 
294 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  29.33 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  28.7 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  39.22 
 
 
292 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  43 
 
 
251 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  32.16 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  34.18 
 
 
296 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  31.3 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  28.99 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  38.78 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  37.25 
 
 
295 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  29.81 
 
 
300 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  29.81 
 
 
300 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  29.81 
 
 
300 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  30.48 
 
 
279 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  37.86 
 
 
278 aa  63.2  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  39.8 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  30.99 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  28.79 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  24.9 
 
 
278 aa  58.5  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  31.09 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  44.55 
 
 
311 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  38.6 
 
 
246 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  26.83 
 
 
291 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  33.33 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  31.79 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0965  abortive infection protein  29.46 
 
 
295 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591955  normal  0.372338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  39.36 
 
 
334 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  27.92 
 
 
297 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  29.38 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5908  abortive infection protein  32.38 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0982731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3329  hypothetical protein  30.82 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2862  CAAX amino terminal protease family protein  31 
 
 
284 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000124869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  32.77 
 
 
278 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  36.13 
 
 
285 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  26.97 
 
 
286 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2822  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000414877 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2573  CAAX amino protease  30 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000633409  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  33.06 
 
 
254 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  33.64 
 
 
278 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2540  CAAX amino protease  30 
 
 
288 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000314156  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  25.95 
 
 
290 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2624  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
288 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000361529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2815  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
288 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000895449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  38.1 
 
 
283 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3974  abortive infection protein  30 
 
 
282 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  29.2 
 
 
306 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  29.2 
 
 
313 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  29.6 
 
 
281 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  29.2 
 
 
775 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  38.67 
 
 
264 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  32.26 
 
 
274 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2976  abortive infection protein  28.93 
 
 
1094 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.292884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>