56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2868 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  100 
 
 
303 aa  584  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  31.98 
 
 
269 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  27.52 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  29.44 
 
 
306 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  32.47 
 
 
281 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  30.83 
 
 
278 aa  95.9  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  31.34 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  34.82 
 
 
272 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  31.13 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  28.05 
 
 
253 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  34.86 
 
 
262 aa  89.4  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  27.6 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  30.51 
 
 
264 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  34.95 
 
 
278 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  30.77 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  36.31 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  30.8 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  26.86 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  27.6 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  27.31 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  40.95 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  30.51 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  28.06 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  31.21 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  30.64 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  30.17 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  29.91 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  24.68 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  24.79 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  32.09 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  37.4 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  28.35 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  31.68 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  31 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  38.74 
 
 
254 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  28.89 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
277 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  30 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  36.73 
 
 
279 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  30 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  29.7 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  35.29 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  28.44 
 
 
267 aa  57.4  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  32.61 
 
 
310 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1638  hypothetical protein  26.79 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  30.99 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  38.68 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  28.42 
 
 
445 aa  49.7  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  36.36 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  32.85 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  30.85 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  31.66 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  40.91 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  28.11 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  42.42 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>