19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1638 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1638  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  33.96 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  31.62 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  25.97 
 
 
291 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  31.53 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  23.76 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  31.12 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  31.69 
 
 
290 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  34.72 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  23.27 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  26.79 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  23.33 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  29.85 
 
 
310 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  25.98 
 
 
269 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  28.57 
 
 
193 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  23.53 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  28.57 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  22.93 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  26.58 
 
 
263 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>