68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3235 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  70.4 
 
 
274 aa  321  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  35.43 
 
 
264 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  36.2 
 
 
269 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  27.17 
 
 
283 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  28.79 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  28.79 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  30.23 
 
 
334 aa  85.9  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  32.02 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  28.96 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  26.86 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  30.12 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  30.67 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  28.52 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  29.28 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  24.28 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  31.36 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  27.63 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  32.6 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  29.61 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  31.72 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  27.37 
 
 
345 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  29.28 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  28.63 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  33.63 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  28.63 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  33.06 
 
 
278 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  34.17 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  27.36 
 
 
193 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0799  Abortive infection protein  28.94 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  29.94 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  33.33 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  32.03 
 
 
295 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  27.71 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  30.69 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  34.86 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  26.09 
 
 
281 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3051  caax amino protease family  28.47 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3235  abortive infection protein  29.01 
 
 
233 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  30.11 
 
 
317 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  33.33 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  55 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  55 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  55 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  29.24 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  55 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  55 
 
 
277 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  34.44 
 
 
304 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  21.94 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  34.78 
 
 
445 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  29 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  24.86 
 
 
286 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  25.71 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  35.16 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  43.75 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  55.26 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  35.29 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  30.59 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  31.82 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3477  abortive infection protein  26.02 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  28.57 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  45.95 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  47.22 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  45.95 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  45.95 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  30.77 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1137  hypothetical protein  33.98 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.918548  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  45.95 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>