29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2236 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  84.59 
 
 
266 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  30.89 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  32.74 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  32.14 
 
 
253 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  24.68 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  26.43 
 
 
281 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  40 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  34.29 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  27.9 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  26.07 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  27.78 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  31.15 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  28.57 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  32.58 
 
 
278 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  32 
 
 
297 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  24.78 
 
 
334 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  35.11 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  26.64 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  40.4 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  25.89 
 
 
278 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  30.63 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  27.34 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  39.34 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  25.65 
 
 
313 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  25.71 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  25.65 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  31.25 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  25.93 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>