63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2149 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  100 
 
 		 254 aa  488  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2236  abortive infection protein  27.43 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2720  Abortive infection protein  36 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000735394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2421  Abortive infection protein  36 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  32.67 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  38.74 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  39.8 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  35.51 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  35.05 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  35.51 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  30.82 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  30.82 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  32.35 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  35.37 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  33.08 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  31.29 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  31.29 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  32.31 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  36.26 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  29.28 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  34.07 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  41.38 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  31.73 
 
 		 310 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  31.63 
 
 		 334 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0943  abortive infection protein  26.54 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  35.85 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  38.71 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  37.37 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  29.03 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  38.2 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  42.59 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  38.3 
 
 		 304 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  26.46 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  33.33 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2131  Abortive infection protein  35.09 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000028196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  42.59 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  29.29 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1501  Abortive infection protein  29.33 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000436117 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  32.58 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1308  Abortive infection protein  34.58 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  31.4 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  29.89 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  29.7 
 
 		 315 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  30.1 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  32.86 
 
 		 319 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  31.18 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  46.15 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  38.95 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  26.17 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  34.71 
 
 		 445 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  31.37 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  35.96 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  29.52 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  34.44 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  44 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1184  hypothetical protein  30.63 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.603632  normal  0.115691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  32.35 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  26.45 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  32.74 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  31.03 
 
 		 279 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1638  hypothetical protein  28.02 
 
 		 270 aa  42  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  43.48 
 
 		 317 aa  42  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>