17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0800 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0800  Abortive infection protein  100 
 
 		 306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0799  Abortive infection protein  52.46 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3477  abortive infection protein  37.7 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  31.36 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  28.07 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0276  Abortive infection protein  29.39 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  30.89 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  23.65 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  24.56 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  23.65 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  29.76 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  29.34 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1918  abortive infection protein  27.92 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  31.54 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1619  abortive infection protein  27.17 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.689653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  25.6 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0131  abortive infection protein  26.73 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805868  normal  0.523045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>