More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4106 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  37.31 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.86 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  39.62 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  37.41 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  37.27 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  35.32 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  38.83 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.18 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  35.77 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  37.87 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  36.14 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  34.42 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.78 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  36.76 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  34.67 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  33.09 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  32.71 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  33.09 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.18 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  39.63 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.19 
 
 		 267 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.96 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  34.15 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  37.1 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  33.1 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  37.98 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  28 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.88 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  27.94 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.61 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  28.35 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.45 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.22 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  29.82 
 
 		 268 aa  88.6  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  25.54 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  26.52 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.79 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  29.18 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  23.84 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.79 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  26.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  26.18 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.54 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  30.91 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  25.82 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  30.47 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  25.91 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.75 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0746  Cof-like hydrolase  23.19 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.46 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  27.86 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  27.56 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  25.9 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  27.05 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  29.6 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  25.72 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  28.21 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0732  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0774  HAD superfamily hydrolase  25.8 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0959252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  23.88 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  30.58 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0900  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.183998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  26.46 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  27.94 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.68 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  30.21 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0436  putative HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.237165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  31.39 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  25.28 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.37 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.98 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.98 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  30.8 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.86 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  30.8 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.86 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.13 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.28 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  22.68 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>