82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3323 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  100 
 
 		 488 aa  984    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  72.57 
 
 		 450 aa  621  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  67.47 
 
 		 415 aa  547  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  62.04 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  29.78 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  29.82 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  27.13 
 
 		 607 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  30.1 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.39 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  27.64 
 
 		 379 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  27.64 
 
 		 379 aa  57  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  26.37 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  27.18 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  23.9 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  23.9 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.35 
 
 		 311 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.86 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.21 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  23.86 
 
 		 317 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.74 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  24.87 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 310 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.35 
 
 		 315 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  28.28 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  24.08 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  25.14 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  24.49 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  24.35 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  24.08 
 
 		 308 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  23 
 
 		 261 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  23.83 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  23.83 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  24.48 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  23.83 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  21.86 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  25.95 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  25.95 
 
 		 281 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  24.16 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1591  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.653679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1537  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473363  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1567  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.17 
 
 		 251 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189705  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  21.99 
 
 		 318 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0488  HflC protein  25.71 
 
 		 295 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  22.66 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  22.84 
 
 		 310 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  24.5 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  21.67 
 
 		 251 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  19.17 
 
 		 270 aa  47  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  22.11 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1280  HflC protein  22.87 
 
 		 297 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.393692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  20.46 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  23.47 
 
 		 265 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  21.63 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.11 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  21.68 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  22.6 
 
 		 305 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  23.71 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  22.6 
 
 		 305 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  27.61 
 
 		 278 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  23.27 
 
 		 248 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  25.74 
 
 		 359 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  23.85 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  24.75 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  22.75 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  25 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.61 
 
 		 248 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  24.46 
 
 		 312 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  23.17 
 
 		 312 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  24.32 
 
 		 259 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 312 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4528  HflC protein  24.56 
 
 		 325 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.788095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  22.47 
 
 		 1017 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  25.93 
 
 		 395 aa  43.5  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  25 
 
 		 340 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>