119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2846 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  100 
 
 
517 aa  1013    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  37.54 
 
 
429 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31 
 
 
319 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.06 
 
 
324 aa  97.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  34.03 
 
 
322 aa  97.4  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  32.49 
 
 
319 aa  94.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  30.64 
 
 
322 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  31.58 
 
 
259 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  30.04 
 
 
266 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.15 
 
 
331 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  28.3 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  25.43 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  24.28 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.45 
 
 
347 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  29.78 
 
 
319 aa  65.1  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  26.36 
 
 
372 aa  63.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  29.09 
 
 
281 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1074  hypothetical protein  36.51 
 
 
303 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.737672  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.05 
 
 
287 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.05 
 
 
287 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4365  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.51 
 
 
308 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155164  normal  0.0204916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36.64 
 
 
307 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  36 
 
 
296 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1219  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  37.01 
 
 
305 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2602  hypothetical protein  35.88 
 
 
308 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.220369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  33.06 
 
 
299 aa  57.4  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1201  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.09 
 
 
319 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.94 
 
 
294 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.38 
 
 
298 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.03 
 
 
310 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  33.33 
 
 
284 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3545  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.06 
 
 
282 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0810177 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  32.03 
 
 
308 aa  54.3  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  30.16 
 
 
296 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3868  zinc metallopeptidase putative  32.03 
 
 
283 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  34.43 
 
 
284 aa  54.3  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28880  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  54.3  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.45 
 
 
294 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  30.95 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  30.16 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.19 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.65 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.16 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.47 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.95 
 
 
288 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  34.38 
 
 
295 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.2 
 
 
279 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.69 
 
 
279 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.95 
 
 
296 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28 
 
 
301 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.52 
 
 
293 aa  51.2  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28 
 
 
301 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  33.33 
 
 
312 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3584  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.71 
 
 
292 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4783  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.71 
 
 
292 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383478  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5500  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.71 
 
 
292 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32.26 
 
 
302 aa  50.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.2 
 
 
295 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.84 
 
 
282 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.2 
 
 
298 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.09 
 
 
284 aa  50.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.03 
 
 
310 aa  50.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  25.88 
 
 
289 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.88 
 
 
289 aa  50.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1678  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.28 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  29.37 
 
 
310 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.4 
 
 
297 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3296  hypothetical protein  27.2 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  28.57 
 
 
287 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.91 
 
 
301 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2711  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.91 
 
 
306 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.97 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  34.13 
 
 
287 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  29.51 
 
 
264 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.03 
 
 
295 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  32.06 
 
 
285 aa  48.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  32 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4167  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.92 
 
 
291 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4690  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.16 
 
 
291 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  27.75 
 
 
287 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  30.33 
 
 
284 aa  48.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0929  hypothetical protein  30.16 
 
 
293 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  27.75 
 
 
287 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.75 
 
 
289 aa  47  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3453  hypothetical protein  27.34 
 
 
297 aa  47  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  32.31 
 
 
297 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.15 
 
 
284 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0936  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.88 
 
 
302 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.367422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>