More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1255 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
349 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  72.62 
 
 
348 aa  504  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  69.63 
 
 
347 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.43 
 
 
346 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.43 
 
 
346 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.57 
 
 
349 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.14 
 
 
346 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.86 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  52.86 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  52.86 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  44.86 
 
 
348 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.43 
 
 
343 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.76 
 
 
348 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  48.59 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  43.02 
 
 
360 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 
341 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 
341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.64 
 
 
341 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.36 
 
 
341 aa  189  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.24 
 
 
341 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  34.93 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
350 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
341 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.28 
 
 
346 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.29 
 
 
353 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
349 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
347 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 
356 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.06 
 
 
344 aa  176  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  39.94 
 
 
347 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  36.29 
 
 
349 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
342 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  34.08 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.34 
 
 
347 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
338 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
350 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
346 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
350 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.94 
 
 
350 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 
355 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.85 
 
 
381 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 
328 aa  149  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.67 
 
 
350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 
350 aa  144  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
349 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.75 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.05 
 
 
336 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  33.8 
 
 
357 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.03 
 
 
341 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  36 
 
 
337 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  31.5 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
344 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.63 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  31.36 
 
 
342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.31 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  33.05 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1376  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.82 
 
 
363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.482993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.2 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25570  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  32.98 
 
 
381 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
342 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.98 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  30.56 
 
 
340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
341 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 
322 aa  125  7e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_52208  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
353 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.9 
 
 
342 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.65 
 
 
340 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
340 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.29 
 
 
347 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.25 
 
 
342 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  30 
 
 
341 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 
347 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.86 
 
 
344 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.86 
 
 
344 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 
340 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.18 
 
 
341 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1311  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
348 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.14429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
342 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  31.98 
 
 
352 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
342 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
342 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 
341 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  31.09 
 
 
340 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.81 
 
 
342 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
344 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  31.92 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 
338 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>