More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4211 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
331 aa  681    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  73.49 
 
 
330 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.09 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.58 
 
 
331 aa  464  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.91 
 
 
324 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  62.77 
 
 
325 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.12 
 
 
336 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.12 
 
 
357 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.72 
 
 
318 aa  394  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.44 
 
 
340 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  61.04 
 
 
338 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.2 
 
 
330 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.72 
 
 
318 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.67 
 
 
320 aa  381  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2222  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.38 
 
 
335 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.53 
 
 
327 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 
323 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
344 aa  347  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.38 
 
 
340 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.76 
 
 
322 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.07 
 
 
322 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.07 
 
 
322 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.69 
 
 
330 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2363  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.04 
 
 
324 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.07 
 
 
322 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
323 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.76 
 
 
322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.76 
 
 
322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.76 
 
 
322 aa  342  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.09 
 
 
336 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 
342 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2246  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.04 
 
 
324 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.844731  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2366  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.46 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.501885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0305  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
336 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2884  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.06 
 
 
341 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.543075  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.81 
 
 
329 aa  333  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.65 
 
 
340 aa  333  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.16 
 
 
336 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.23 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.87 
 
 
358 aa  328  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.03 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0957  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 
357 aa  325  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.177421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.45 
 
 
340 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.23 
 
 
331 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.1 
 
 
355 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1124  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.46 
 
 
323 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0644506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.06 
 
 
357 aa  322  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.5 
 
 
362 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3680  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.68 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00834015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.8 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  51.2 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5507  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.69 
 
 
349 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0494  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.71 
 
 
355 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.774907  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0481  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.71 
 
 
355 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.37 
 
 
318 aa  316  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.25 
 
 
342 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.83 
 
 
355 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.86 
 
 
354 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.8 
 
 
307 aa  315  8e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.22 
 
 
312 aa  315  8e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.74 
 
 
362 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.43 
 
 
354 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2456  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.67 
 
 
353 aa  314  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2098  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.7 
 
 
356 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4128  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.35 
 
 
352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0972084  hitchhiker  0.00000000618238 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.15 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4335  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.1 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796314  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
351 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1986  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.94 
 
 
352 aa  311  6.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.84 
 
 
358 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.15 
 
 
356 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  51.62 
 
 
354 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1491  dTDP-D-glucose-46-dehydratase  46.65 
 
 
352 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.59 
 
 
353 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1272  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.65 
 
 
351 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.447034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1183  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.94 
 
 
351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.769877  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.09 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.89 
 
 
307 aa  309  4e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.7 
 
 
353 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1658  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.12 
 
 
359 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.548961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3054  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.71 
 
 
350 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.02 
 
 
348 aa  308  9e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.28 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1995  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.76 
 
 
357 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.10362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5836  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.52 
 
 
350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3235  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.88 
 
 
352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.82 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.43 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3391  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.42 
 
 
354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.478209  normal  0.0989265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4019  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50 
 
 
352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  50.59 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.56 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0482  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  49.85 
 
 
349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2679  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.35 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0614199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.89 
 
 
354 aa  305  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  48.51 
 
 
350 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3502  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  47.25 
 
 
363 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>